Oddělení hydrologie tvoří základ pobočky. „Původně tu byla malá kancelář, kde pracovali pouze čtyři lidé. Meteorologie se připojila až kolem roku 1980,“ podotýká ředitel pobočky Pavel Polcar s tím, že díky relativně čistému vzduchu v kraji nemají ani úsek ochrany ovzduší.