Přírodní památka Šebeň jen těžko odolává atakům kůrovce. Zarůstající paseky mravencům neposkytují vhodná stanoviště pro stavbu mravenišť ani dost potravy. I přes citelný pokles mravenčí populace na Šebeni tam ještě mohou návštěvníci najít stovky obydlí těchto zvláště chráněných tvorů.